За свою долгую и яркую карьеру Фоньини стал одним из самых известных представителей итальянского тенниса современности.
На счету Фоньини победа на турнире «Большого шлема» в парном разряде2015 года в дуэте с Симоне Болелли, чемпион 17 турниров ATP и победа на турнире категории «Мастерс» в Монте-Карло в 2019 году. Наивысшим в рейтинге ATP стало 9-е место в мире.
Последний матч в профессиональной карьере Фабио Фоньини состоялся 30 июня 2025 года в первом круге Уимблдона. Его соперником был испанец Карлос Алькарас, вторая ракетка мира.
Встреча продолжалась 4 часа 37 минут и завершилась поражением Фоньини в пяти сетах со счетом 5:7, 7:6 (7:5), 5:7, 6:2, 1:6.