«Сине-бело-голубые» и итальянский футболист достигли соглашения о досрочном прекращении контракта.
Маркизио присоединился к «Зениту» 3 сентября 2018 года, провел 15 матчей и забил два мяча. Вместе с «сине-бело-голубыми» он стал чемпионом России.
В апреле хавбек перенес операцию на колене. «Зенит» сообщил, что на восстановление игроку потребуется от четырех до шести месяцев.