Дмитрий является воспитанником калининградского футбола. С 2023 года он выступал за молодежную команду «Балтики», проведя 39 матчей, забив три гола и отдав восемь результативных передач.
1 июля 2024 года Никитин дебютировал за «Балтику-2», где в 22 матчах отметился шестю голами и тремя ассистами.
В сезоне 2024/25 Дмитрий впервые сыграл за главную команду «Балтики» в матче против «Арсенала» 24 мая.
