Фабиан присоединился к «Динамо» в июле 2021 года и провел за команду три сезона. За это время 33-летний защитник сыграл 89 матчей и забил 8 голов, дважды помогая клубу завоевать бронзовые медали чемпионата России.
Рыночная стоимость Бальбуэны, по данным Transfermarkt, составляет около 2,8 млн евро. Ранее он выступал за бразильский «Коринтианс» и английский «Вест Хэм Юнайтед».