В 2016 году специалист помогал Дмитрию Аленичеву в московском «Спартаке», а позже входил в тренерский штаб Массимо Карреры.
3 мая 2018 года заявил об уходе из «Спартака» и желании возобновить самостоятельную работу.
Последним клубом Пилипука был грозненский «Ахмат» — с сентября прошлого года он работал в должности старшего тренера.
Добавим, что минское «Динамо» по итогам прошлого сезона заняло третье место в чемпионате страны.